對于每一套膜裝置，人們都希望它較大限度的發揮作用，希望有較高的脫鹽率，較大的透水量和盡可能長的壽命，要達到上述三點，供水水質是至關重要的，因此進入膜裝置的原水必須有良好的預處理。
合理的預處理對反滲透裝置長期安全運行是十分重要的。有了滿足反滲透進水水質要求的預處理，就可以確保產水流量維持穩定、脫鹽率維持在某一值上的時間長、產品水回收率可以不變、運行費用達到較低、膜使用壽命較長等。具體來說，反滲透預處理是為了做到：
（1）防止膜表面上污染，即防止懸浮雜質、微生物、膠體物質等附著在膜表面上或污堵膜元件水流通道。
（2）防止膜表面上結垢。反滲透裝置運行中，由于水的濃縮，有一些難溶鹽沉積在膜表面上，因此要防止這些難溶鹽的生成。
（3）確保膜免受機械和化學損傷，以使膜有良好的性能和足夠長的使用時間。
對膜進行清洗
盡管料液經過各種預處理措施，長期使用后膜表面還可能產生沉積和結垢，使膜孔堵塞，產水量下降，因此對污染膜進行定期的清洗是必要的。但反滲透膜系統不能等到污染很嚴重后才來清洗，這樣將會增加清洗難度，也使清洗步驟增多和清洗時間延長。要正確地把握清洗時機，及時清除污垢。
清洗原則：
了解當地水質特征，對污染物進行化學分析，通過結果分析，來選擇較佳的清洗劑和清洗方法，為特定的給水條件下找出較佳方法提供依據；
清洗條件：
a . 產品水量比正常時下降5%-10%。
b. 為保正產品水量，修正溫度后的供水壓力增加10%-15%。
c. 透過水質電導率(含鹽量增加)增加5%-10%。
d. 多段RO系統，通過不同段的壓降明顯增加。
清洗方法：
先進行系統反沖，再進行負壓清洗，有必要的情況下進行機械清洗，再進行化學清洗，有條件的可以超聲清洗，在線電場清洗是一種很好的方法，便價格昂貴；由于化學清洗效果比較好，其余方法有些不容易實現，而各供應商提供的藥劑雖名稱及使用方法不盡相同，但其原理大致相同。如我公司現使用膜清洗劑MC2、MA10。
清洗步驟如下（清洗單段系統）：
⑴配置清洗液；
⑵低流量輸入清洗液；
⑶循環；
⑷浸泡；
⑸高流量水泵循環；
⑹沖洗；
⑺重啟系統。
針對特殊污染物清洗有：清洗硫酸鹽垢、清洗碳酸鹽垢、清洗鐵錳污染、清洗有機物污染等。
避免膜在高壓下運行
系統在啟停時有殘余氣體存留，使系統在高壓狀態下運行。系統中過濾器前后的壓力表用于監視濾芯的壓降，初級及終級壓力表則用于監視RO膜組件壓降。調節進水閥及濃水閥以保證運行壓力及回收率。若運行中產水流量或總流量下降，或初級與中級有壓差比運行初期的壓差增加較大時(以初始運行新反滲透膜組件數據為標準)，則需對系統進行沖洗或清洗，以保證膜組件的性能安全全。
1、設備排空后，重新運行時，氣體沒有排盡就快速升壓運行。應在系統的壓力下將余下的空氣排盡后，再逐步升壓運行。
2、在預處理設備與高壓泵之間的接頭密封不好或漏水時(尤其是微米過濾器及其后的管路漏水)當預處理供水不很足時，如微米過濾器發生堵塞，在密封不好的地方由于真空會吸進部分空氣。應清洗或更換微米過濾器，保證管路不漏。
3、各運行泵的運轉是否正常，流量是否與規定的值相同，并與泵運行曲線比較，以確定運行壓力。
注意關機時的操作
1、關機時快速降壓沒有進行徹底沖洗。由于膜濃水側的無機鹽的濃度高于原水，易結垢而污染膜。準備關機時，逐步降壓至3bar左右用預處理好的水沖洗14～16分鐘。
2、在準備關機時，投加化學試劑，會使藥劑滯留在膜及膜殼中，引起膜污染，影響膜的使用壽命。應停止投加。
